Ánder Lafuente llegó a los juveniles del Athletic Club en 1999 procedente del histórico Arenas para enrolarse en el equipo de Liga Nacional. Dos años después pasó al Baskonia, club vinculado al Athletic y en el que permaneció un par de temporadas antes de pasar a engrosar las filas del Bilbao Athletic, donde también jugó dos campañas. Tanto en el Baskonia como en el filial rindió a buen nivel. Concretamente, en el "B", donde coincidió con hombres como Amorebieta, Ustaitz o Fernando Llorente, disputó un total de 61 partidos y marcó 5 goles en esos dos años. 

 Sin embargo, a pesar de su rendimento, en 2005 abandona Lezama. "Cerré una etapa en la que viví bonitas experiencias. Salí del club sin hacer ruido. Desde entonces he ido corrigiendo errores y superando pasos hasta ser el jugador que soy hoy en día", dijo el jugador en Deia en 2010 recordando su marcha. 

Su nuevo destino fue el FC Cartagena. En su primera temporada como albinegro coincidiría con Juan Ignacio Martínez, y realiza una campaña muy buena, destacando como jugador desequilibrante, de desborde y con llegada al área. El Efesé se clasifica para jugar la fase de ascenso a Segunda como campeón del grupo IV de Segunda "B", pero el Vecindario se cruzó en el camino.

Sus otras dos campañas en Cartagena tuvieron como tónica la irregularidad, en especial la 2007-2008. Seguía siendo un fijo en las alineaciones y, cuando estaba inspirado, sacaba de su chistera goles y jugadas de mucho peligro, pero quizá se esperaba de él una explosión que no llegaba a producirse. Así, Fabri, que llegó al equipo en verano de 2008, no contó con él para la 2008-2009, por lo que Lafuente abandona el Efesé. Su primer ciclo cartagenerista se cierra con casi una centena de partidos jugados y 10 goles.

Juan Ignacio, que acababa de llegar al banquillo del Albacete, insistió para que su nuevo club contratara al vasco, pero la operación se truncó y su nuevo destino fue el Granada CF, en Segunda "B", con el que firma por una temporada con opción a otra en julio de 2008. 

El equipo andaluz estaba sumido en una grave crisis económica y deportiva, y eso se vio reflejado en una mediocre temporada en la que acabó en mitad de la tabla. Lafuente es titular en la banda izquierda de los de la Alhambra y anota 6 goles. Y es que, pese a no cuajar una gran temporada, el vasco sobresale del discreto nivel general que muestra su equipo. 

En el verano de 2009 el FC Cartagena asciende a Segunda y se encomienda a Juan Ignacio la dirección de la nave albinegra para el ansiado debut en la categoría. Entre las peticiones del nuevo técnico en su retorno se encuentra Lafuente y, al contrario de lo que le pasó en Albacete, esta vez sí consigue hacerse con el vasco. El resto ya lo conocemos. La temporada 2009-2010 cierra muchas bocas y se erige como una de las revelaciones del torneo liguero, hasta el punto de que se interesan por él equipos de Primera como el Real Zaragoza y el Athletic Club. Técnicos de este último equipo llegaron a seguirle en directo en varios partidos y Lafuente se pronunció en Deia al respecto afirmando que "es un halago que se interese por mí el Athletic, y mentiría si dijera que no me hace ilusión volver a casa". En cualquier caso, no se concretó nada y el jugador, que había firmado por una campaña con renovación automática si jugaba más de 30 partidos, prorrogó su contrato con el FC Cartagena. 

La pasada temporada, algunos problemas físicos, la irregular marcha del equipo y el hecho de tener que jugar varios encuentros por la banda derecha -a pesar de ser diestro se muestra más cómodo jugando por la izquierda- provocaron que no estuviera tan brillante como la anterior, pero aún así dejó detalles de la calidad que atesora. 

Para la 2011-2012 no estará Juan Ignacio, quizá el entrenador que, hasta la fecha, más rendimiento ha sabido sacar de Ánder. Pero el pequeño jugador echará mano de su calidad técnica, su habilidad y su rapidez para continuar siendo clave en el juego albinegro.